
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科研后果
与探讨考生与探讨伴随着要在保鲜冷库室保存时长减少羊肉片的硬性、持水力发电、色度、分散铁含铁、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4标准来估评肌组建细胞系膜的铁身故形态。结杲提示 ,要在保鲜冷库室保存时长减少后,羊肉片的硬性在第四天和第6天强势削减;持水工作能力削减;色彩变深,丢失亮光,鲜桔大红色转变成暗桔大红色。除外,分散铁、几丁质酶氧和MDA的含铁强势扩大,细胞系膜凋亡率强势增加。 深入进行定性分析的人员去除有之间的关系保温时的肌群打样定制的球血清质含量,最后采取SDS-PAGE进行定性分析,球血清质含量条带在有之间的关系年间区域不均且差不多(图1a)。只能根据球血清在有之间的关系打样定制中的表示情况发生,进行定性分析出现 同种组打样定制的中十位数快要于同种层次(图1b),原因分析肌群打样定制球血清质含量拥有更好的组内差不多性和组间之间的关系性。 球氨基酸组学共认定出1996种球氨基酸。以B0为对应组,淘汰B1、B2、B4和B6中的球球血清使用相互影响表示爱探讨,共认定到377个DEPs。将火山图大数据可视化,并据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两根基准探讨DEP。数据如下图一样1c-f一样,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别认定出22、33、73和140个DEPs,之中分刘海别上浮6、11、32和87个,下跌16、22、41和55个。聚类分析法方式 分析评估了各种不同保鲜的时候力量组织性中球氨基酸的表示爱,数据彰显力量球球血清表示爱相互影响发生变化储放时光的扩大而扩大(图1g)。
图1| 不同的冷藏库时候的健身肌肉土样淀粉酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有对比 保鲜事件的全身肌肉试品对比蛋白酶定性分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死忙球蛋白肽的PRM按量讲解(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依据KEGG聚集对比描述蛋白质的铁阵亡制度(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT酶联免疫法血清质组学技术设备应用工作管理,拜谱生物制品已科研做好并成立了改善心智成熟的转录组学、血清组学、消化吸收组学和两组学整合的产品技术设备应用工作管理管理体制,欢迎致电咨询!
考虑论文资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.