
2024年9月由长沙渔业大学生张万刚教导专业团体在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物体为该研究提供了亚硝基化掩盖组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
2英文名称:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202四年影响到因素:5.7
展现期限:2024年9月
客公司:南京农业大学
学习建筑材料:蛋白
拜谱提供数据的技术:亚硝基化修饰组学
枝术规划:
一、分析最终
01.Caspase-3亲水性
现下尚不明白NO对caspase-3的能够抑做成用是否需要归因于NO介导的S-亚硝基化,各种不同溶液浓度均值的GSNO用于外源性NO提供,以介导caspase-3的身体S-亚硝基化。成果得出结论,与不会GSNO的组不同于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3活力性有明显大大减少(图1),与之前曝光不对。GSNO外理大大减少caspase-3活力性的隐藏的因素仍亟待阐述。
图1 有差异 酸度的GSNO补救对caspase-3活力的后果
02.Caspase-3的S-亚硝基化水平
实验Caspase-3的亚硝基化的程度上,以阐发GSNO对Caspase-3的的反应性。经GSNO净化处理后,加测到caspase-3蛋白质S-亚硝基化程度上延长(图2)。某些没想到阐明,外源性GSNO培育可取得成功诱发caspase-3的身体S-亚硝基化。惹人难以相信的是,在不长期存在GSNO长期存在的差表组中加测到其中一个忽闪的S-亚硝基化带,这阐明caspase-3或许的发生内源性的S-亚硝基化。还有就是,本实验中caspase-3的S-亚硝基化的程度上较高,而caspase-3的活性氧减小,这与事先的实验一直。那么,caspase-3的特喜欢的人S-亚硝基化装饰位点尚不很明白,还都要进一次的经历。
图2 GSNO治疗对caspase-3S-亚硝基化品质的的影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化突显组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。蓝颜色标上的字段标识S-亚硝基化肽,粉红色标上的C标识S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3溶解结蛋清
结血清酶做为的最主要的肿瘤生殖细胞骨架血清酶,在提升肌肿瘤生殖细胞型式的型式系统性和回缩性问题起着最主要用处,调查S-亚硝基化caspase-3对结血清酶吸附的敏感脆弱性兼备最主要意议。与Std(未用胱天血清酶酶-3和GSNO孵育的初使肌化学纤维板血清酶)组好于,0 μM GSNO组(肌原化学纤维板和caspase-3的孵育,无GSNO)的系统结血清酶量的特殊降底,表述caspase-3对结血清酶兼备存在的血清酶血清质水解程度。在GSNO孵育后,系统结血清酶的量的凸显提升(P < 0.05)。不仅,当GSNO盐浓度身高时,系统结血清酶的量的定期上涨(P < 0.05)(图5)。一项发觉表述,SNO遮盖的caspase-3以水平方向根据的方式遏制结血清酶的吸附。
图5.S-亚硝基化caspase-3光降解结淀粉酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3生物降解肌钙淀粉酶-T
肌钙蛋清-T (TnT)是原肌球蛋清上下调整复杂胸肌紧缩的细细的的须得肌原仟维材料蛋清。TnT的光光生物分解塑料表现形式是论文测量到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化学习能力下,caspase-3对TnT的光光生物分解塑料问题下图6图甲中,与Std组(包含caspase-3和GSNO的肌原仟维材料)相对比,caspase-3组中30 kDa TnT情节同质性增强,揭示caspase-3操作了TnT的光光生物分解塑料,除此以外,caspase-3与GSNO的孵育出现30 kDa TnT急剧下降。在100和200 μM GSNO组中并没有论文测量到明显的的相互直接直接影响(P > 0.05),而当GSNO的含量达成400 μM 时,该情节同质性减掉(P < 0.05)。这部分显示揭示了SNO淡化的caspase-3对TnT光光生物分解塑料的自动调节用。结蛋清和TnT是caspase-3的铭感底物,而GSNO外理拉低了caspase-3的几丁质酶能能出现肌原仟维材料蛋清光光生物分解塑料学习能力拉低了。上述情况根据上述,NO介导的S-亚硝基化能能采用淡化半胱氨酸残基来上下调整caspase-3的几丁质酶,必将逐渐骤直接直接影响其对结蛋清和TnT的蛋清蛋白质水解学习能力,因此直接直接影响牛肉片的质量。
图6. S-亚硝基化caspase- 3可降解肌钙血清-T
二、总结ppt
本探析广泛宣传研究综述S-亚硝基化对caspase-3呈现的后果十分其次对牛羊肉肌原植物合成纤维身体光降解的后果。核核蛋白质S-亚硝基化可呈现caspase-3的半胱氨酸残基,最终得以影响caspase-3可溶性消减,进一歩压制了其对牛羊肉肌原植物合成纤维核核蛋白质的核核蛋白质蛋白质水解程度。三、拜谱个人心得体会
研究分析方案使用了酶活核查,亚硝基化淡化组学剖析,WB等检查有效途径,察觉淀粉酶S-亚硝基化能能淡化caspase-3的半胱氨酸残基,这引致了caspase-3活力性的下降,齐头并进第一步克制了其对牛肉片肌原人造纤维淀粉酶的淀粉酶油脂水解性能。本研究分析方案为解说淀粉酶质亚硝基化对肉嫩的调整机理能提供打了个个新的层面。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的血清质组学、体现血清质组学、分泌组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸一系列护肤品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total氧化物恢复、自由巯基,欢迎大家咨询!
基准文献资料:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663