草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿装置常用见的病毒组成。肾团队中CaOx单晶体过过剩基性岩会引致肾小管肿瘤细胞破损和凋亡，最后引致肾结石的养成。短链蛋白质的酸由肠管内生物滤池革兰氏阴性菌进行发酵营养健康人造纤维形成，这不仅在高斯模糊肠管深层中起到功能，另外在装置级别上也起到关键的功能。至少，丁酸是最非常丰富的短链蛋白质的酸，具备有消除炎症和免疫力调节功能,本深入分析探析丁酸对CaOx肾结石的功能以至于意向靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山三甲医院泌尿产科吴忠院士、周子健医生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲师、周子健教授在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱菌物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络信息临床药理学的服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

内容公司名称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 合作方计量单位：华山医院科室 科学研究人：大鼠、HK-2細胞 排序企业信息：照表组（Con）、实体模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱带来了的技术：手机网络药剂学学查测

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研发工人先要实现大鼠型号，用生理特点生化学指标体系和组织结构病症学脱色等研发途径显示丁酸应该提高CaOx型号大鼠肾CaOx硫化锌的生成和板材损害，改善效果CaOx型号大鼠的细菌感染板材损害和腐蚀产物的过分呈现。于此，丁酸还有抑制性草酸诱惑的HK-2肿瘤受损细胞板材损害、腐蚀应激状态和肿瘤受损细胞凋亡。 为研发性学习丁酸构成和靶人类遗传人类染色体遗传组网格，研发技术人员从PubChem获取一个丁酸和丁酸酯的二维和三维图构成（图1A）。借助PharmMapper统计数据信息信息库和Uniprot统计数据信息信息库实施处理后共建立出1115个丁酸靶人类遗传人类染色体遗传组供进的一步统计数据具体分析一下。将人类遗传人类染色体遗传组统计服务器导成STRING统计数据信息信息库，实施PPI网格统计数据具体分析一下。Cytoscape说出了排列的前20的交通核心站靶人类遗传人类染色体遗传组的详细完整网格图，涵盖CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。某些交通核心站人类遗传人类染色体遗传组与网格中的其他人类遗传人类染色体遗传组均行为出固定的相应性，说明书怎么写某些人类遗传人类染色体遗传组几率挥发着协用途途。GO和KEGG统计数据具体分析一下证明了丁酸交通核心站人类遗传人类染色体遗传组的相应前提条件和菌物学系统（图1C）。交通核心站人类遗传人类染色体遗传组主要是与类固醇雌多种多样素回话、钝化应激性性回话、催化几丁质酶氧神经元对类固醇雌多种多样素多种多样的反响及及对强酸化学上材料的反响业内。结合以上经验，某些交通核心站人类遗传人类染色体遗传组主要是直接参与了钝化应激性性和对催化几丁质酶氧的菌物反响进程，是肾结石产生新机制中至关为重要性的前提条件，这得出结论丁酸几率在肾结石中挥发为重要性用途。

图1| 丁酸架构与靶dna手机网络具体分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进这一步探求丁酸对CaOx肾结石着实切靶遗传染色体，学习技术人力凭借GEO的数据报告库对GSE73680中键康差表与CaOx肾结石用户的遗传染色体一定的差异采取了学习。差表组与CaOx结石用户的涉及到的性性一定的差异表述方法方式遗传染色体（DEGs）检测标准规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个遗传染色体出现涉及到的性发生变化，在当中3379个（89.4%）遗传染色体表述方法方式调涨，404个（10.6%）遗传染色体表述方法方式调低（图2A）。对DEGs采取聚类分析介绍介绍，热图出现了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类分析介绍表现形式（图2B）。紧接着，学习技术人力对其进行GeneCards的数据报告库人力亲子鉴定了370个概率与CaOx肾结石涉及到的的遗传染色体，排名就前20位的预估遗传染色体简答涉及到的性计分如下图一样2C一样。为了更好地寻得丁酸疗法CaOx肾结石的关键所在靶点，学习技术人力将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石涉及到的遗传染色体处置收获打了个个Venn图。终于，CYP2C9被选定为丁酸干扰CaOx肾结石的内在的靶点(图2D)。于此，学习技术人力还采取了丁酸与CYP2C9的分子结构衔接，CYP2C9的八个氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相互之间的作用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在利于微信网络药学学预侧CYP2C9是丁酸影响力CaOx肾结石的靶DNA后，研究方案拜谱生物还借助受损细胞膜检测得知了CYP2C9可影响草酸引导的HK-2受损细胞膜的ROS情况、真菌感染板材损害和凋亡。

图2| 基本上据库携手深入分析預測CYP2C9是丁酸的作用于CaOx肾结石的靶人类基因

探析后果

本探讨1找到丁酸在身体之外和身上均能促使CaOx肾结石建模的氧化反应反应应激性反应和细菌感染损害，之后完成线上药剂学学学挑选拥有丁酸会影响CaOx肾结石的潜在的靶点——CYP2C9，最后的完成癌細胞实验所否认CYP2C9在草酸盐诱骗的HK-2癌細胞ROS标准、细菌感染损害和凋亡。以上找到体现了丁酸可能性完成促使CYP2C9来促使CaOx肾结石的氧化反应反应应激性反应，减少细菌感染损害。该环节中拜谱海洋生物工程打造了线上药剂学学学新贴心服务谘询性，不但拜谱海洋生物工程可增长熟进一步完善的人类基因组学、蛋清质组学、基础代谢组学等几组学食品及新贴心服务谘询性，受欢迎致電谘询！ 参阅文章：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.