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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一直都在是矿业辅料而被所知的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“基础代谢有害垃圾”成了“宝藏地方小原子核”的心酸发展史同类,也许有一天近10多久才被出现其重要的的菌物学的功能,再也“侧睡农奴把独唱”,特殊是在免疫系统病症性病症分析行业领域内推陈出新。原有几篇综述通讯稿了在各种各样的病症性病症的食草动物三维模型中给衣康酸或其生物学体现衍菌物的医疗益处,并出现其不确定性靶点。并于衣康酸的“上一世”与“这辈子”,详情软文《乳酸的逆袭女神战友——衣康酸!选文让你熟知 衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用体现蛋清组学产品,实现1000+高妙度突显位点检测出,平稳逆转经典之作靶点,全多方面生信定性分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发掘”到“效验”全流量服务的,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、研究操作流程

02、试验数据资料

03、经“点”重新

在测评数据源中,排除几个参考文献中媒体报道的精典靶点名词解释衣康酸呈现位点,如第一点个被表明的衣康酸共价呈现淀粉酶KEAP1,和糖酵解径路中的3个重要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各种炎性小体根据淀粉酶NLRP3和人体细胞死亡时中的重要淀粉酶RIPK3等,其质谱图以下几点图图甲中。

04、类产品特征

1.各种方面质控

企业化特异形测试探针孵育、SDS-PAGE查测、WB检验、子样本有关于性具体分析等甲乙双方向查测,确保安全的项目最终信得过性。

2.高效能质谱测量仪器平台网站

在Orbitrap Astral全新新一批高辩别质谱仪六道金刚咒下,实现了衣康酸性反应装饰位点及淀粉酶检测新纵深,助力器科学有效研究方案新知道。

3.全流量站台式服务于

通过拜谱海洋生物成熟的试验机构,可提供了“体细胞培养出→测试探针孵育→WB监测→艰深度衣康硝化作用装饰监测→独有的生信浅析→某位点PRM验正”全程序流程贴心服务,省时省钱更好些。

05、具体分析资源(个部分)

06、拜谱生物导向

PART 2、资料分享一下

资料一

日语大标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

简体中文标题文字:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探讨相关内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

参考文献二

英语网站标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文字幕网站标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研究方案项目:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、案例库并衍生要点

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13存在弱于的底物依照能力素质,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物工程衣康硝化作用绘制组测试数据表格中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用突显(详细图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结

算作TCA巡环中的前面产生物,衣康酸调准产生、免疫性抗体系统和感染范围内的主动的功效,为的控制免疫性抗体系统感染性病提拱了用于的控制政策。衣康酸节构中的亲电性α,β-不是处于饱和状态羧酸节构能对淀粉酶质上的可溶性半胱氨酸残基进行烷基化绘制(迈克尔暴击伤害的反应),该翻譯后绘制被称作“衣康酸绘制(itaconation)”,从根本上不良影响淀粉酶质功效,调空免疫性抗体系统对答和产生经过,为不同病用药研制开发提拱新理念。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化淡化血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医药学绝参考值靶向药物产生组(QMT1000)或电能排泄靶向治疗排泄组车辆对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

选取学术论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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